34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4482 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  860    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  26.49 
 
 		 395 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  27.44 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  31.16 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  31.35 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  28.52 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  28.57 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  30.4 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  27.57 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  26.69 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  25.68 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  22.82 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  28.75 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  26.11 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  22.87 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  24.49 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  22.41 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  22.41 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  22.3 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  22.41 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  22.07 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  22.07 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  22.07 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  25.47 
 
 		 356 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  21.72 
 
 		 426 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.05 
 
 		 745 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  27.18 
 
 		 362 aa  43.5  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1238  hypothetical protein  25.72 
 
 		 509 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0729  hypothetical protein  25.61 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>