More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3319 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  61.05 
 
 
729 aa  914    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  100 
 
 
724 aa  1477    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  48.89 
 
 
727 aa  709    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  62.48 
 
 
726 aa  920    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  65.66 
 
 
726 aa  959    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0582  dehydrogenase E1 component  63.05 
 
 
714 aa  887    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  63.12 
 
 
728 aa  905    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  60.64 
 
 
729 aa  907    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  34.08 
 
 
675 aa  349  9e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  32.41 
 
 
791 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  34.47 
 
 
669 aa  303  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  31.82 
 
 
680 aa  287  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  31.43 
 
 
657 aa  283  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  29.95 
 
 
823 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  28.74 
 
 
659 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  29.96 
 
 
658 aa  264  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  28.27 
 
 
659 aa  260  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  31.99 
 
 
710 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  28.74 
 
 
668 aa  250  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  32.08 
 
 
666 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  28.34 
 
 
659 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  30.53 
 
 
617 aa  235  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  30.3 
 
 
736 aa  231  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  29.32 
 
 
678 aa  226  2e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  31.71 
 
 
702 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2780  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  35.87 
 
 
332 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0316753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2588  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.43 
 
 
332 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2776  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.43 
 
 
332 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2539  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  35.33 
 
 
332 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2505  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component alpha subunit  37.13 
 
 
332 aa  212  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2825  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.13 
 
 
332 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4117  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.54 
 
 
345 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1630  dehydrogenase, E1 component  38.27 
 
 
360 aa  211  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0754823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2804  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.13 
 
 
332 aa  210  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2578  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.13 
 
 
332 aa  210  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000958625  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3772  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  33.33 
 
 
320 aa  210  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.514041  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0029  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  33.33 
 
 
320 aa  210  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2033  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  36.47 
 
 
328 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1796  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.99 
 
 
348 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.281194  hitchhiker  0.0011937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2059  dehydrogenase E1 component  38.68 
 
 
346 aa  209  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1603  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.99 
 
 
348 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112007  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  39.57 
 
 
324 aa  207  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  40.12 
 
 
324 aa  207  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3019  dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunits  29.12 
 
 
652 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2508  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.72 
 
 
332 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.558644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2785  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 alpha-subunit  37.72 
 
 
332 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0988  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.92 
 
 
361 aa  205  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0916856  normal  0.876159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1505  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  36.86 
 
 
345 aa  204  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3141  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.76 
 
 
341 aa  203  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.29724 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2363  dehydrogenase E1 component  37.61 
 
 
332 aa  203  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.706778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3050  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.67 
 
 
332 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1036  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, alpha subunit  36.45 
 
 
323 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0124954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2909  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  39.52 
 
 
349 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1908  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  39.64 
 
 
381 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1863  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.91 
 
 
327 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.0011894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5140  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.91 
 
 
327 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215052  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  36.34 
 
 
327 aa  200  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  36.34 
 
 
327 aa  200  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1415  dehydrogenase, E1 component  38.37 
 
 
346 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000304037 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0878  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, alpha subunit  34.89 
 
 
322 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00306772  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1218  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  33.66 
 
 
322 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6240  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.59 
 
 
327 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0171  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  35.24 
 
 
331 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1839  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.59 
 
 
327 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5154  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.7 
 
 
360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  39.51 
 
 
320 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0416  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase alpha subunit  39.6 
 
 
326 aa  197  6e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3014  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  40.24 
 
 
349 aa  197  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.449207  normal  0.161117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2786  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  40.24 
 
 
349 aa  197  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2230  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.65 
 
 
346 aa  197  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.753771  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1434  dehydrogenase E1 component  39.17 
 
 
327 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3718  pyruvate dehydrogenase E1 component alpha subunit  37.22 
 
 
347 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3887  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  37.22 
 
 
343 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1750  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.59 
 
 
327 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181454  normal  0.0181262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1076  dehydrogenase E1 component  39.5 
 
 
348 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0313  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.74 
 
 
327 aa  196  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1777  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.59 
 
 
327 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0802  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase alpha subunit  37.46 
 
 
334 aa  195  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.565164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1818  dehydrogenase, E1 component  39.01 
 
 
342 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379197  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0584  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.76 
 
 
338 aa  193  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.576457  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2443  dehydrogenase complex, E1 component, alpha subunit  37.15 
 
 
325 aa  193  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1224  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  40.57 
 
 
376 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.42946  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0519  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  38.02 
 
 
344 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5072  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  39.19 
 
 
323 aa  192  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496091  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  32.92 
 
 
325 aa  191  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  34.46 
 
 
325 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  34.85 
 
 
328 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  37.27 
 
 
332 aa  191  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0525  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  38.92 
 
 
356 aa  190  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.3038 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  36.98 
 
 
337 aa  190  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  36.98 
 
 
337 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0786  pyruvate dehydrogenase (lipoamide)  36.2 
 
 
327 aa  190  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.506136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1437  dehydrogenase E1 component  37.72 
 
 
348 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  35.26 
 
 
326 aa  190  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5920  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  37.38 
 
 
327 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0329  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  34.66 
 
 
326 aa  189  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1129  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, alpha subunit  38.68 
 
 
346 aa  188  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.857436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  36.61 
 
 
467 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3888  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  38.87 
 
 
335 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.262988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  36.98 
 
 
337 aa  188  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>