137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2192 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2192  stress protein  100 
 
 
437 aa  866    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  38.69 
 
 
413 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  32.48 
 
 
427 aa  245  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0946  tellurium resistance protein, putative  31.9 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2136  stress protein  30.48 
 
 
431 aa  202  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0119  stress protein  46.43 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  43.64 
 
 
479 aa  109  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  39.55 
 
 
449 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  37.79 
 
 
493 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  32.89 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  39.44 
 
 
722 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  31.6 
 
 
453 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.57 
 
 
590 aa  93.2  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  40.68 
 
 
545 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  38.2 
 
 
528 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  33.17 
 
 
394 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  33.17 
 
 
394 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  33.17 
 
 
394 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  35.09 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  32.46 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  34.36 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  34.71 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  34.12 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  33.52 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  35.47 
 
 
560 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  32.98 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  41.1 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  34.5 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  36.99 
 
 
689 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  34.42 
 
 
418 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  34.67 
 
 
191 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  31.02 
 
 
402 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  36 
 
 
191 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  24.88 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  24.88 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  32.34 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  24.02 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  34.04 
 
 
191 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  33.33 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  33.11 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  34 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  32.45 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  27.63 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  30.08 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2572  hypothetical protein  26.97 
 
 
398 aa  69.7  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376371  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  28.88 
 
 
191 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  28.88 
 
 
191 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  27.74 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  30.2 
 
 
186 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  34.25 
 
 
675 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  31.79 
 
 
192 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  29.41 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  32.28 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  32.28 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  32.28 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  35.1 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  27.42 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  27.42 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  27.42 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  30 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  32.28 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  32.28 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  32.45 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  32.45 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  28.34 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  32.89 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  30.92 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  31.38 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  31.65 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  32.21 
 
 
192 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  30.67 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  31.58 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5506  hypothetical protein  25.11 
 
 
248 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491224  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  30.26 
 
 
191 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  32.73 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  31.22 
 
 
192 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  30.2 
 
 
192 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  33.11 
 
 
191 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  28.95 
 
 
194 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  29.14 
 
 
191 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  28.34 
 
 
191 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  29.14 
 
 
191 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  34.1 
 
 
317 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  27.63 
 
 
196 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  27.63 
 
 
196 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  26.74 
 
 
192 aa  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  27.63 
 
 
196 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  27.63 
 
 
194 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  30.32 
 
 
191 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  27.63 
 
 
194 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  32.89 
 
 
191 aa  63.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  28.29 
 
 
194 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  27.42 
 
 
432 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  32.89 
 
 
192 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  28.49 
 
 
191 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  30.92 
 
 
191 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  26.97 
 
 
194 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  26.97 
 
 
194 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  26.97 
 
 
194 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  26.97 
 
 
194 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>