225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1888 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  68.6 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  63.95 
 
 
91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  62.35 
 
 
98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  64.71 
 
 
95 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  65.43 
 
 
94 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  57.47 
 
 
89 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  61.25 
 
 
91 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  61.18 
 
 
95 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  56.96 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  56.96 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  56.96 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  57.69 
 
 
93 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  57.65 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  57.33 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  56.58 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3598  acylphosphatase  63.38 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  52.27 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  51.72 
 
 
87 aa  78.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1143  acylphosphatase  52.94 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563511  decreased coverage  0.00936648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  51.14 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0918  acylphosphatase  47.13 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  45.88 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  50.63 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  44.71 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  46.84 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  47.89 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  45.35 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  47.06 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  49.32 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  41.86 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  41.18 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  41.86 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  41.25 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2214  putative acylphosphatase  42.53 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4027  acylphosphatase  52.5 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  39.53 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  41.86 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  41.86 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  41.86 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  41.86 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  41.86 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  40.7 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  46.58 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  46.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  40.7 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  40.7 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  47.83 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  51.52 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  40.23 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1027  acylphosphatase  39.53 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0204097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  48.61 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  35.63 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  45.12 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  43.84 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  42.31 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  33.33 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  41.03 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0910  acylphosphatase  41.86 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  41.03 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  41.03 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  39.53 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  44.59 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  41.38 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  38.37 
 
 
97 aa  57.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  43.04 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  42.5 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_899  acylphosphatase-like protein  38.37 
 
 
91 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000672405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02367  acylphosphatase  41.33 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  33.72 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  46.25 
 
 
92 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  45.57 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  32.56 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  45.12 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  46.15 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  48.61 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1465  acylphosphatase  40.7 
 
 
567 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  35.8 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  37.21 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  41.98 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  41.67 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  37.5 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  44.87 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  38.75 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2182  acylphosphatase  42.11 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404717  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  37.5 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  36.05 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0969  acylphosphatase  36.59 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000144451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  41.86 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  42.65 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1303  acylphosphatase  37.08 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  44.19 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  44.26 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  47.62 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  37.93 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  36.78 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>