192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4027 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4027  acylphosphatase  100 
 
 
95 aa  179  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1888  acylphosphatase  52.5 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000874264  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  48.84 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  51.19 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09560  acylphosphatase  50 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5955  acylphosphatase  51.72 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.924836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2778  acylphosphatase  48.81 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2075  acylphosphatase  50 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7993  Acylphosphatase-like protein  50 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  45.88 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4189  acylphosphatase  47.67 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.702907  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  52.86 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0214  acylphosphatase  54.29 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  45.88 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3431  acylphosphatase  51.19 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.708113  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3598  acylphosphatase  53.52 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1143  acylphosphatase  50 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563511  decreased coverage  0.00936648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  48.57 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  48.57 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  48.57 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  60 
 
 
87 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1572  acylphosphatase  47.78 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.100357 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  42.05 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0999  acylphosphatase  46.25 
 
 
104 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00530798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  45.24 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  38.96 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1465  acylphosphatase  63.83 
 
 
567 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  40.74 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  40.66 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.67 
 
 
756 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  53.7 
 
 
393 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1571  acylphosphatase  45.71 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00643387  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  44.71 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  44.59 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  42.53 
 
 
94 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  44.29 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  38.27 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  42.68 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.68 
 
 
766 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  39.19 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  47.62 
 
 
92 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  43.37 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  44.44 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2228  acylphosphatase  35.62 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1940  acylphosphatase  35.62 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  40.96 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  40.96 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  50.91 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  40 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3282  acylphosphatase  41.98 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.297011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22230  acylphosphatase  40.7 
 
 
99 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  54.55 
 
 
90 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  39.76 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1323  acylphosphatase  48.15 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  41.18 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  40.96 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  36.71 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  36.71 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0681  acylphosphatase  46.43 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1727  acylphosphatase  39.73 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  47.44 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  46.99 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  43.02 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  34.18 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  34.57 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  37.18 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  50 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  37.65 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1211  acylphosphatase  37.04 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0664194  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51920  acylphosphatase  41.46 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  34.48 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1288  acylphosphatase  35.06 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  53.85 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  43.75 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  42.5 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1125  acylphosphatase  40.68 
 
 
578 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000234918  normal  0.35011 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1449  acylphosphatase  32.91 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  37.66 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  46.15 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2743  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.78 
 
 
760 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  38.1 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0206  acylphosphatase  34.57 
 
 
179 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1047  acylphosphatase  60 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  38.96 
 
 
91 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  40 
 
 
89 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_008709  Ping_2182  acylphosphatase  35.44 
 
 
90 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.404717  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  43.1 
 
 
92 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  39.29 
 
 
92 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0122  acylphosphatase  36.71 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  34.15 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  36.05 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  41.07 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  36.14 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  39.51 
 
 
93 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  43.1 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  43.1 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  39.76 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  43.1 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  43.1 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>