46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1179 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1179  dienelactone hydrolase  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.401039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6559  dienelactone hydrolase-like protein  44.15 
 
 
270 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04550  dienelactone hydrolase-like enzyme  41.87 
 
 
278 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0809694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0876  hypothetical protein  37.99 
 
 
284 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1155  hypothetical protein  36.23 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0655389  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1165  hypothetical protein  36.23 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746782  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1138  hypothetical protein  36.23 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4940  hypothetical protein  33.22 
 
 
284 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1479  hypothetical protein  34.3 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.909184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13475  hypothetical protein  38.25 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000130156  hitchhiker  0.00071947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1708  hypothetical protein  32.01 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  37.67 
 
 
301 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  29.63 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
514 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  32.35 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  27.78 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  27.91 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_93787  predicted protein  25.44 
 
 
346 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770884  normal  0.222874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.27 
 
 
370 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.64 
 
 
533 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  30.33 
 
 
547 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  29.94 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.93 
 
 
572 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  27.44 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  31.54 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  24.69 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.32 
 
 
568 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.93 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  27.83 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  28.11 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  26.22 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  24.82 
 
 
348 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  27.44 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  31.54 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  30.41 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  27.2 
 
 
320 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  29.45 
 
 
524 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  28.87 
 
 
406 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  27.22 
 
 
291 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>