More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0518 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0518  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 433 aa  890    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0778  glutamyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.532093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1535  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 456 aa  335  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0208  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 443 aa  322  6e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0884118  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0795  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4722  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.69 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0607  glutamyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 456 aa  310  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5220  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0131  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3674  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 450 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.351322  normal  0.059122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4753  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0295087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0967  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5295  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 449 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.676196 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0983  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 459 aa  293  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2945  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1016  glutamyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0429  glutamyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0454904  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0382  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.699293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2675  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193444  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2439  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.536597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2098  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00800716  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  38.91 
 
 		 445 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4602  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5563  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2455  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 441 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2275  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  0.24806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0884  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0428129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0797  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3636  glutamyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1104  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 449 aa  255  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.052178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2622  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0688  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.544153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2748  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 440 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 467 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 464 aa  208  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1094  glutamyl-tRNA synthetase  30.87 
 
 		 464 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal  0.0937945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 		 470 aa  206  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 485 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  31.41 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 468 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2734  glutamyl-tRNA synthetase  31.2 
 
 		 469 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 479 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 468 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1609  glutamyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 		 462 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 469 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 490 aa  199  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1951  glutamyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 486 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0884384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  30.24 
 
 		 463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 500 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  31.91 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1690  glutamyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863945 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0894  glutamyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.101678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 469 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 469 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 469 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 466 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  30.95 
 
 		 463 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 473 aa  196  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3370  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0214607  normal  0.182767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 472 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 485 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 469 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 		 465 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 483 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 472 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 483 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  31.36 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3757  glutamyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00456424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 467 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 472 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 501 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 		 469 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 464 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 469 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>