42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2164 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
211 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  85.31 
 
 
211 aa  364  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  71.56 
 
 
218 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  71.56 
 
 
218 aa  298  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  71.56 
 
 
218 aa  298  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  68.34 
 
 
210 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  50.23 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  49.76 
 
 
208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  51.43 
 
 
211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  52.51 
 
 
212 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  57.4 
 
 
210 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  52.72 
 
 
183 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  52 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  53.63 
 
 
181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  52.33 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  47.37 
 
 
198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  49.7 
 
 
214 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  44.92 
 
 
197 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  47.03 
 
 
201 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  49.19 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  45.5 
 
 
241 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  42.35 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  45.91 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  52.71 
 
 
223 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  49.59 
 
 
205 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  46.92 
 
 
246 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  42.25 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  38 
 
 
215 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  38.62 
 
 
247 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  36.81 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  35.84 
 
 
229 aa  98.2  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  38.78 
 
 
258 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  38.33 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  35.19 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  32.29 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  31.85 
 
 
139 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  30.47 
 
 
164 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  31.25 
 
 
325 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  28.91 
 
 
142 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  27.43 
 
 
125 aa  45.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  25.17 
 
 
301 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2666  Vitamin K epoxide reductase  26.14 
 
 
126 aa  41.6  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>