27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1661 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
147 aa  299  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  70.99 
 
 
144 aa  202  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  59.56 
 
 
141 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  59.56 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  59.56 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  45.71 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  45.71 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  45.71 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  38.17 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  39.45 
 
 
155 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  41.67 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  32.81 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  36.04 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.71 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.83 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>