48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1264 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  100 
 
 
194 aa  402  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  86.32 
 
 
188 aa  347  5e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  56.59 
 
 
195 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  56.18 
 
 
183 aa  210  9e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  55.62 
 
 
183 aa  208  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  55.62 
 
 
183 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  57.49 
 
 
183 aa  208  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  54.29 
 
 
183 aa  201  7e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  55.87 
 
 
182 aa  191  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  55.87 
 
 
182 aa  191  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  37.58 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  35.95 
 
 
164 aa  72  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  32.89 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  29.61 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  33.1 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  35.48 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  33.55 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  34.19 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  36.08 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  34.44 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  33.56 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  32.68 
 
 
164 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  32.24 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  29.01 
 
 
172 aa  55.1  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  28.49 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3102  Ferritin Dps family protein  27.33 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  30.43 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  25.75 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  25.75 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  25.75 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  25.75 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  25.75 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  25.75 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  25.75 
 
 
162 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  30.2 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2520  Ferritin Dps family protein  25.81 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0352668  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  25.15 
 
 
162 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  29.41 
 
 
182 aa  44.7  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  27.08 
 
 
167 aa  44.7  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  27.78 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  25 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  30.66 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  26.71 
 
 
163 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  22.62 
 
 
175 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  29.67 
 
 
181 aa  41.6  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  29.67 
 
 
181 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>