62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0181 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
109 aa  223  9e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0720597  normal  0.202817 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  83.49 
 
 
104 aa  187  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1437  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  78.9 
 
 
103 aa  174  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60.38 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.33 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2023  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  58.49 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2612  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  57.41 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2321  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  56.48 
 
 
109 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157203  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.71 
 
 
315 aa  90.1  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000481953 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0238  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.91 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0239  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.43 
 
 
178 aa  72  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2120  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.65 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 
61 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000461685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0113  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.71 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.13 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3775  ferredoxin I  39.71 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  38.1 
 
 
275 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.76 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000213739  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  28.44 
 
 
218 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  28.44 
 
 
218 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  26.85 
 
 
202 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5031  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
559 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  31 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
557 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.349649  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.7 
 
 
1004 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.36 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.432587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4845  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
561 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0779804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4462  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.45 
 
 
561 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.409413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
561 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36171  normal  0.408424 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.87 
 
 
427 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1168  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  28.28 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  28.28 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  28.28 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 
208 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.66 
 
 
431 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 
368 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 
208 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  29.29 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  29 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10903  NADPH:adrenodoxin oxidoreductase fprB  50 
 
 
575 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 
208 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.33 
 
 
371 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  32.81 
 
 
502 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 
193 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  27.27 
 
 
208 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2152  molybdopterin oxidoreductase  35.29 
 
 
880 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0025  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000336302  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1184  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.68406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 
477 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  26.26 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.68 
 
 
687 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 
973 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.87 
 
 
425 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0558  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.53 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0453  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.43 
 
 
445 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  29.58 
 
 
1150 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0634  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
354 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
699 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0324842  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 
544 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  34.33 
 
 
417 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>