26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0238 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0238  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  336  8e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0239  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.84 
 
 		 178 aa  214  5e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0384  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.83 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1437  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.91 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0720597  normal  0.202817 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0443  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.21 
 
 		 315 aa  80.5  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000481953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2612  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.92 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2023  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.09 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.09 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0541  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.72 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2321  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.57 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.08 
 
 		 925 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.52 
 
 		 924 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.55 
 
 		 929 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.18 
 
 		 963 aa  44.7  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.1 
 
 		 945 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2120  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 		 62 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.04 
 
 		 957 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 		 989 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 		 989 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1888  ferredoxin  27.08 
 
 		 307 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.55 
 
 		 924 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0275  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.27 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000213739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4046  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.74 
 
 		 61 aa  41.2  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000461685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  24.58 
 
 		 312 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.32 
 
 		 937 aa  40.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>