26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1151 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 117 aa  224  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1376  Roadblock/LC7 family protein  80.34 
 
 		 117 aa  169  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0196587 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  36.21 
 
 		 115 aa  86.7  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  36.21 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  34.48 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  31.03 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  33.64 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  27.88 
 
 		 258 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  31.03 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  25.93 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  28.44 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  29.36 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  29.06 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  29.06 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  27.78 
 
 		 265 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  24.35 
 
 		 115 aa  43.9  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1020  hypothetical protein  30.84 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0409339  hitchhiker  0.000000330929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  23.48 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  23.48 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 134 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2355  hypothetical protein  23.48 
 
 		 119 aa  40  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>