18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0459 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  742    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  74.74 
 
 
380 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  46.69 
 
 
388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  45.03 
 
 
409 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  46.96 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  46.94 
 
 
393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  33.95 
 
 
388 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  37.55 
 
 
288 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  31.74 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  24.73 
 
 
522 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  25.93 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  28.53 
 
 
596 aa  76.3  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  23.91 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1836  hypothetical protein  23.28 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000360269  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0132  membrane protein-like  26.84 
 
 
577 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  29.49 
 
 
1276 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1408  hypothetical protein  26.05 
 
 
180 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.753488  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1743  conserved hypothetical protein  25.97 
 
 
851 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>