More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0115 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0115  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 116 aa  228  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0778651  normal  0.359579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0013  nitrogen regulatory protein P-II  86.09 
 
 		 116 aa  201  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271001  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  77.59 
 
 		 119 aa  186  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0900  nitrogen regulatory protein P-II  68.1 
 
 		 117 aa  169  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2055  nitrogen regulatory protein P-II  58.62 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0108  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.834215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0129  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0837985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3050  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.59817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.96 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  45.54 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0112  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  45.54 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  45.54 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0087  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.7  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.7  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.54 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2893  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0162783  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2671  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000399348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0159  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 114 aa  95.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.75 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000155222  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.86 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.75 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  95.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.86 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.28 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  44.64 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  43.93 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>