More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0087 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0087  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  223  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0095  nitrogen regulatory protein P-II  93.81 
 
 		 113 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1998  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  91.15 
 
 		 113 aa  209  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2671  nitrogen regulatory protein P-II  92.04 
 
 		 113 aa  205  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000399348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0090  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  90.27 
 
 		 113 aa  202  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0129  nitrogen regulatory protein P-II  76.11 
 
 		 113 aa  183  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0837985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0108  nitrogen regulatory protein P-II  73.45 
 
 		 113 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.834215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  54.39 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  53.51 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  52.63 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3159  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.37 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0808  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0779  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.49 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  47.37 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  42.98 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.61 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  47.37 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  47.37 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0532  nitrogen regulatory protein P-II  49.57 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 113 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>