33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5549 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  62.61 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  57.39 
 
 
119 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  57.39 
 
 
119 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  60 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  58.04 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  48 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  44.3 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  40 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  43.84 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  40 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  38.96 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  42.86 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  40 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  39.76 
 
 
109 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  35.78 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  32.08 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  29.52 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  34.67 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  40.3 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  32.71 
 
 
108 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  37.5 
 
 
120 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  35.63 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  31.03 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  28.75 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  26.51 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0286  hypothetical protein  29.67 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.48956  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  31.51 
 
 
610 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  32.89 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  34.67 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  28.07 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  25.27 
 
 
332 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.22 
 
 
327 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>