76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5238 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5238  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3624  hypothetical protein  36.36 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3916  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  99  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4236  hypothetical protein  31.76 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75102  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  32.67 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5654  hypothetical protein  33.11 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4728  protein of unknown function DUF892  27.7 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.211819  hitchhiker  0.00586961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  29.3 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0170  protein of unknown function DUF892  28.38 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  31.21 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  28.48 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  27.56 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  25.64 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  28.1 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  29.87 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  38.74 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  31.85 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  31.85 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  31.85 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  40 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  40 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  40 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  40 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  38.82 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  38.82 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  38.82 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  40 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  31.2 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  38.82 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  38.82 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  38.82 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  27.33 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  33.64 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  34.26 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  31.21 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  26.57 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  24.54 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  28.1 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  26.42 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  32.38 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1129  hypothetical protein  27.21 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  28.97 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1241  protein of unknown function DUF892  27.86 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  25.97 
 
 		 168 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  23.93 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  30.38 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  27.88 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  34.12 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  28.28 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  31.2 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  33.61 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  26.92 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2208  hypothetical protein  28.47 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  24.05 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  27.1 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  29.27 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  29.09 
 
 		 217 aa  44.3  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  27.52 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  25.53 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  33 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  46.15 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  25.16 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  30.92 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  46.15 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5840  protein of unknown function DUF892  33.02 
 
 		 253 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  28.08 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  30.48 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  30.63 
 
 		 198 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  28.08 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  32.65 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>