26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4787 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  62.36 
 
 
300 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  54.93 
 
 
299 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  45.32 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  45.98 
 
 
333 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  44.06 
 
 
333 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  42.01 
 
 
335 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  42.07 
 
 
372 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  39.08 
 
 
339 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  38.17 
 
 
303 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  30.2 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  31.6 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  26.04 
 
 
330 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  27.64 
 
 
333 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  25.74 
 
 
330 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  23.46 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  29.81 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  20.95 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0710  hypothetical protein  22.59 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.03339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  24.88 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  24.88 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  22.49 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  21.28 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  21.28 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  21.28 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  21.45 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>