More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1497 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  100 
 
 
222 aa  423  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  74.44 
 
 
226 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  46.86 
 
 
216 aa  191  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  44.91 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 
221 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  39.34 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  41.18 
 
 
276 aa  161  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  48.24 
 
 
233 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 
225 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
231 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  38.32 
 
 
225 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
236 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  39.52 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  45.11 
 
 
242 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 
266 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
280 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  36.36 
 
 
259 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  37.11 
 
 
498 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 
296 aa  121  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.36 
 
 
265 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  33.74 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 
498 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.55 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  36.33 
 
 
499 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  39.22 
 
 
265 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.05 
 
 
267 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.63 
 
 
272 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.05 
 
 
267 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.52 
 
 
284 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  37.93 
 
 
265 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.57 
 
 
278 aa  115  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.6 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  37.07 
 
 
266 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.7 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  35.66 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.95 
 
 
267 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.2 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0917  ABC transporter related  36.4 
 
 
240 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.834023  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
257 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
257 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
257 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  37.44 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.43 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  35.12 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  36.63 
 
 
264 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.66 
 
 
260 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.06 
 
 
310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  38.63 
 
 
267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3313  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.67 
 
 
502 aa  108  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  36.03 
 
 
269 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  39.53 
 
 
648 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  37.77 
 
 
267 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  37.44 
 
 
272 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  37.89 
 
 
262 aa  108  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  30.17 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.71 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  36.21 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.47 
 
 
309 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  38.86 
 
 
666 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.98 
 
 
270 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  37.96 
 
 
652 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
307 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
307 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  34.32 
 
 
281 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 
261 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
307 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.45 
 
 
272 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3258  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
272 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
307 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  34.52 
 
 
277 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  32.14 
 
 
363 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  40.18 
 
 
587 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  36.29 
 
 
301 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  35.86 
 
 
278 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
307 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  40.82 
 
 
229 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  32.63 
 
 
275 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
307 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.63 
 
 
274 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
307 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  38.83 
 
 
650 aa  105  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.89 
 
 
257 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  36.68 
 
 
661 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  37.24 
 
 
277 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.89 
 
 
257 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  37.24 
 
 
277 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>