20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4974 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4974  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  763    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4460  hypothetical protein  86.59 
 
 
409 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4924  hypothetical protein  86.34 
 
 
409 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0637585  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1955  hypothetical protein  37.18 
 
 
352 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1040  hypothetical protein  46.9 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3817  hypothetical protein  39.45 
 
 
352 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438372  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  26.11 
 
 
409 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  26.95 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  26.47 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  26.58 
 
 
417 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  27.01 
 
 
394 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  27.24 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  27.12 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  23.7 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  26 
 
 
411 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  29.84 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  26.77 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  27.09 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  25.94 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  27.78 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>