58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3972 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3972  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 283 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 		 131 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 		 136 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  41.56 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  40.96 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  52.73 
 
 		 135 aa  48.9  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  51.11 
 
 		 121 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 121 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  54.17 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  53.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  53.33 
 
 		 122 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  50.91 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  50.91 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  50.91 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  53.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  53.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  53.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  53.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  53.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  49.02 
 
 		 68 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 122 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 121 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 122 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 176 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  41.54 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 128 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  28.17 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 		 135 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  46.43 
 
 		 133 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  46.43 
 
 		 133 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  35.06 
 
 		 133 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  35.06 
 
 		 133 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 125 aa  42.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 128 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>