29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0410 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0410  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 99 aa  193  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  48.04 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  41.41 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  41.58 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  36.73 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  39.22 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  36.27 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  36.73 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  33.98 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  33.98 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3538  DNA polymerase beta subunit  37.78 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  36.36 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  40.32 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1757  DNA polymerase, beta-like region  34.65 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.511346  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  36.27 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  39.18 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  32.93 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  47.62 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 98 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  40.74 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  30.3 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  33.33 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  58.62 
 
 		 96 aa  40.8  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  39.24 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 96 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>