More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0389 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0389  RecG-like helicase  100 
 
 		 636 aa  1286    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0493519 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2813  helicase domain protein  33.15 
 
 		 653 aa  276  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.208739  normal  0.570688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3682  helicase domain-containing protein  36.31 
 
 		 629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4215  helicase domain-containing protein  31.27 
 
 		 664 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00111168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.76 
 
 		 681 aa  249  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.52 
 
 		 786 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.16 
 
 		 818 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.1 
 
 		 815 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.03 
 
 		 753 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.7 
 
 		 818 aa  244  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.38 
 
 		 682 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.68 
 
 		 678 aa  242  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.06 
 
 		 676 aa  243  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.17 
 
 		 706 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.15 
 
 		 672 aa  241  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.15 
 
 		 799 aa  240  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.57 
 
 		 706 aa  236  9e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.23 
 
 		 671 aa  234  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.06 
 
 		 706 aa  234  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.72 
 
 		 818 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.08 
 
 		 779 aa  233  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.35 
 
 		 765 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1212  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.6 
 
 		 699 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.376481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.12 
 
 		 703 aa  232  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.18 
 
 		 767 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.24 
 
 		 817 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.92 
 
 		 686 aa  230  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.92 
 
 		 686 aa  230  5e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.29 
 
 		 688 aa  230  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.41 
 
 		 690 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0594  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.97 
 
 		 686 aa  229  1e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.64 
 
 		 712 aa  228  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.87 
 
 		 747 aa  227  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.65 
 
 		 679 aa  226  7e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.95 
 
 		 728 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.32 
 
 		 671 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.5 
 
 		 818 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.8 
 
 		 827 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.25 
 
 		 706 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.33 
 
 		 714 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.77 
 
 		 685 aa  224  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.45 
 
 		 718 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.29 
 
 		 700 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.14 
 
 		 772 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.14 
 
 		 772 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.83 
 
 		 822 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.42 
 
 		 689 aa  223  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.62 
 
 		 908 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.83 
 
 		 676 aa  223  8e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.02 
 
 		 819 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.02 
 
 		 778 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.02 
 
 		 819 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.28 
 
 		 682 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.84 
 
 		 715 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.09 
 
 		 715 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.96 
 
 		 703 aa  222  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.15 
 
 		 679 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.87 
 
 		 689 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.84 
 
 		 763 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.83 
 
 		 690 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.73 
 
 		 693 aa  220  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2072  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.02 
 
 		 696 aa  220  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.57 
 
 		 776 aa  220  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.97 
 
 		 691 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.41 
 
 		 681 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.46 
 
 		 682 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.76 
 
 		 706 aa  219  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.78 
 
 		 779 aa  219  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.19 
 
 		 717 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.59 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.21 
 
 		 682 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.46 
 
 		 682 aa  219  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.22 
 
 		 719 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.1 
 
 		 822 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.76 
 
 		 706 aa  219  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.46 
 
 		 682 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.56 
 
 		 693 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.4 
 
 		 564 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.86 
 
 		 829 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.46 
 
 		 682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.46 
 
 		 657 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.46 
 
 		 682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.46 
 
 		 682 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.58 
 
 		 827 aa  218  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.19 
 
 		 792 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.08 
 
 		 693 aa  217  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.56 
 
 		 693 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.19 
 
 		 785 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.61 
 
 		 702 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.59 
 
 		 689 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.42 
 
 		 693 aa  216  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.34 
 
 		 737 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1263  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.93 
 
 		 798 aa  216  9e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00177655  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.4 
 
 		 693 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.06 
 
 		 685 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.26 
 
 		 682 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.11 
 
 		 685 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1530  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.39 
 
 		 606 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.4 
 
 		 693 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.4 
 
 		 693 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>