30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2335 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  98.39 
 
 
186 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  94.09 
 
 
186 aa  358  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  84.41 
 
 
186 aa  322  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  77.84 
 
 
186 aa  309  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  76.76 
 
 
186 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  77.3 
 
 
186 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  75.14 
 
 
186 aa  302  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  76.22 
 
 
186 aa  302  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  75.14 
 
 
186 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  73.12 
 
 
186 aa  288  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  70.11 
 
 
187 aa  278  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  67.39 
 
 
186 aa  268  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  39.2 
 
 
245 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  35.98 
 
 
255 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  35.45 
 
 
251 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  36.93 
 
 
182 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  36.42 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  36.42 
 
 
183 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  31.46 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  28.74 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  94.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  31.69 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  31.15 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  29.12 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  29.78 
 
 
194 aa  89  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  27.53 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  28.42 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  26.82 
 
 
201 aa  54.3  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0640  hypothetical protein  24.84 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>