54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1659 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  56.57 
 
 
179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  52.22 
 
 
188 aa  160  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  38.41 
 
 
187 aa  131  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  41.03 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  39.62 
 
 
174 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.89 
 
 
170 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.37 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  41.72 
 
 
161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.75 
 
 
176 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.16 
 
 
178 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  37.21 
 
 
174 aa  104  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  34.68 
 
 
500 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  36.63 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.59 
 
 
178 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.59 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.59 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.38 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  36.05 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  34.38 
 
 
493 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.05 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  36.05 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.98 
 
 
500 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  33.96 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.14 
 
 
494 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  31.52 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.69 
 
 
491 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.69 
 
 
491 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.56 
 
 
494 aa  81.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  32.93 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.97 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  32.52 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  36.77 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.57 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0694768 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05938  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 
272 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  34.03 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17110  predicted protein  29.23 
 
 
212 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0710818  normal  0.446796 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  34.44 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  31.47 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.29 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52100  possible complex I intermediate associated protein  25 
 
 
262 aa  50.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04740  hypothetical protein similar to N-succinyl-5-aminoimidazole-4-carboxamide ribotide synthetase (Eurofung)  23.85 
 
 
393 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477656  normal  0.113084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  24.31 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08341  hypothetical protein  23.61 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44936  predicted protein  25.26 
 
 
392 aa  47.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08111  hypothetical protein  23.61 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119688  Probable complex I intermediate-associated protein 30-like protein  29.58 
 
 
402 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  30.99 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1689  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.47 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  27.59 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  33.07 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  23.61 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  30.23 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  22.42 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>