28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2697 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2697  Nucleotide binding protein PINc  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0273  nucleic acid binding protein  51.88 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0693481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2393  nucleotide binding protein, PINc  47.8 
 
 		 162 aa  143  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0774  hypothetical protein  44.38 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000572112  hitchhiker  0.0000000000460396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0974  nucleic acid binding protein  38.51 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.424226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  40.15 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1315  hypothetical protein  36.71 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.962808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2682  hypothetical protein  38.22 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2713  hypothetical protein  36.71 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.996068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0753  nucleic acid-binding protein consists of a PIN domain and a Zn-ribbon module-like protein  35.44 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2062  hypothetical protein  36.94 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00995263  normal  0.160551 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0036  Nucleotide binding protein PINc  34.55 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0439  nucleotide binding protein  33.74 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000374231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1807  hypothetical protein  32.7 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0090  hypothetical protein  36.02 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0739  nucleic acid binding protein  33.54 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.627957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3470  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.429439  decreased coverage  0.000626371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1370  hypothetical protein  32.72 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0313  hypothetical protein  32.72 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1301  hypothetical protein  32.72 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0577  hypothetical protein  31.87 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.26207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1362  hypothetical protein  32.92 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.846641  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41444  predicted protein  31.4 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08253  proteasome maturation ans ribosome synthesis protein Nop10, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04000)  46.38 
 
 		 431 aa  52  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0327035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04300  art-4 protein, putative  42.42 
 
 		 494 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31725  predicted protein  36.17 
 
 		 629 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42470  Predicted RNA-binding protein Nob1p involved in 26S proteasome assembly  39.71 
 
 		 481 aa  42.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0736  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>