36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2413 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  100 
 
 
909 aa  1783    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  42.32 
 
 
862 aa  602  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  41.9 
 
 
847 aa  562  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  40.5 
 
 
941 aa  542  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0550  hypothetical protein  38.58 
 
 
773 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000581827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  31.26 
 
 
892 aa  350  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0065  hypothetical protein  34.72 
 
 
754 aa  229  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000275591  decreased coverage  0.0000022772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  27.39 
 
 
1231 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  34.95 
 
 
576 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1308  hypothetical protein  36.25 
 
 
361 aa  171  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0304738  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  30.8 
 
 
616 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0471  hypothetical protein  38.1 
 
 
356 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.876595  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  36.09 
 
 
828 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0705  hypothetical protein  36.51 
 
 
346 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.318197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  23.09 
 
 
1292 aa  101  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0595  hypothetical protein  44.76 
 
 
196 aa  99.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0651  hypothetical protein  28.44 
 
 
347 aa  96.3  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.020449  normal  0.173426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  24.3 
 
 
1095 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1180  hypothetical protein  29.55 
 
 
312 aa  93.2  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.111365 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  44.95 
 
 
326 aa  92.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1876  hypothetical protein  26.15 
 
 
300 aa  89  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.360253  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1964  hypothetical protein  26.38 
 
 
333 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.833026 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1535  hypothetical protein  25 
 
 
811 aa  84.3  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0148901  hitchhiker  0.00829639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0631  hypothetical protein  36.51 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.606141  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3033  hypothetical protein  26.34 
 
 
351 aa  80.1  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0459  hypothetical protein  23.05 
 
 
340 aa  77  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.115859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1551  hypothetical protein  30.11 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285681  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2457  hypothetical protein  38.89 
 
 
186 aa  69.7  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1675  hypothetical protein  25.64 
 
 
339 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2148  hypothetical protein  35.51 
 
 
176 aa  64.7  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43566  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  24.78 
 
 
929 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  25.28 
 
 
593 aa  62.4  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  29.93 
 
 
364 aa  56.2  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0799  hypothetical protein  29.31 
 
 
201 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2025  hypothetical protein  29.31 
 
 
205 aa  49.3  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0865236 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1183  hypothetical protein  35.04 
 
 
194 aa  48.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.780381  normal  0.0653972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>