19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0471 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0471  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  709    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.876595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0705  hypothetical protein  35.47 
 
 
346 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.318197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  38 
 
 
909 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  36.59 
 
 
847 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  36.59 
 
 
862 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0651  hypothetical protein  34.98 
 
 
347 aa  145  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.020449  normal  0.173426 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3033  hypothetical protein  33.79 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  34.33 
 
 
576 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  29.71 
 
 
828 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  32.11 
 
 
616 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1876  hypothetical protein  29.04 
 
 
300 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.360253  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  28.63 
 
 
1231 aa  93.6  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  28.92 
 
 
892 aa  89.4  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0459  hypothetical protein  27.01 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.115859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1551  hypothetical protein  29.79 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285681  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  30.23 
 
 
941 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1675  hypothetical protein  27.23 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  24.23 
 
 
1095 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  28.41 
 
 
1292 aa  49.7  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>