20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1675 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1675  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  673    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  33.33 
 
 
862 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  32.28 
 
 
847 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  30.42 
 
 
616 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0651  hypothetical protein  35.04 
 
 
347 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.020449  normal  0.173426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0705  hypothetical protein  29.43 
 
 
346 aa  86.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.318197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  28.99 
 
 
1231 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0471  hypothetical protein  27.53 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.876595  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1876  hypothetical protein  27.2 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.360253  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  30.2 
 
 
941 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  26.3 
 
 
828 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0459  hypothetical protein  24.2 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.115859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3033  hypothetical protein  32.74 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  25.32 
 
 
909 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  29.31 
 
 
892 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 
576 aa  59.3  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1551  hypothetical protein  26.71 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285681  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1303  phosphogluconate dehydratase  26.11 
 
 
601 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  27.16 
 
 
1095 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1181  phosphogluconate dehydratase  26.11 
 
 
601 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>