More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1933 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1933  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 309 aa  616  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.041451  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1658  ATP-dependent protease La  49.84 
 
 		 307 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1954  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.36 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1787  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.02 
 
 		 628 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4930  Sigma 54 interacting domain protein  34.09 
 
 		 652 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.327719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 		 800 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 810 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 783 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  36.84 
 
 		 786 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0315  hypothetical protein  35.4 
 
 		 614 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.463593 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1597  hypothetical protein  35.4 
 
 		 614 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000203225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  35.34 
 
 		 824 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1838  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 805 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  32.61 
 
 		 812 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0532  hypothetical protein  35.4 
 
 		 614 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.26777  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3496  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 812 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.473507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 806 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 806 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0873  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.85 
 
 		 550 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0384  hypothetical protein  33.86 
 
 		 606 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 785 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  36.03 
 
 		 785 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 784 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 785 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  33.82 
 
 		 781 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  35.51 
 
 		 809 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 785 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  36.03 
 
 		 785 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  36.03 
 
 		 785 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  36.03 
 
 		 785 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  33.82 
 
 		 816 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  33.82 
 
 		 816 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  32.12 
 
 		 780 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3432  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  35.29 
 
 		 797 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  35.77 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 		 785 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0794  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.62 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000691143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 821 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  33.1 
 
 		 776 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  33.1 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  33.1 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  36.23 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  33.1 
 
 		 776 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  33.1 
 
 		 773 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 787 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  31.88 
 
 		 816 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  28.04 
 
 		 798 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  36.5 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0490  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000003188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0509  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 		 785 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4350  Sigma 54 interacting domain protein  31.67 
 
 		 650 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  34.53 
 
 		 799 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0362  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00395  hypothetical protein  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  30.19 
 
 		 811 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0499  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00131573  hitchhiker  0.00467921 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  33.09 
 
 		 793 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0553  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00718767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0492  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00217408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0482  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000167472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0525  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 799 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000828536  normal  0.526776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 785 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3193  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000724307  hitchhiker  0.000504746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  34.56 
 
 		 806 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 801 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 787 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  34.31 
 
 		 786 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 756 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2971  ATP-dependent protease  30.19 
 
 		 619 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2649  ATP-dependent protease  30.19 
 
 		 619 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  30.11 
 
 		 802 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  33.82 
 
 		 783 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1374  hypothetical protein  30.52 
 
 		 632 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00571338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  32.61 
 
 		 773 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  32.39 
 
 		 773 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  36.5 
 
 		 816 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  32.39 
 
 		 776 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  30.43 
 
 		 835 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  32.39 
 
 		 773 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3494  Lon protease  35.29 
 
 		 798 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  35.29 
 
 		 798 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  32.39 
 
 		 776 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 804 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  32.33 
 
 		 810 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  34.56 
 
 		 804 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  32.39 
 
 		 776 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  33.58 
 
 		 784 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  32.73 
 
 		 817 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  36.03 
 
 		 804 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>