36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1213 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  57.14 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  54.46 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  57.73 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  57.73 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  56.57 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  52.53 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  36.89 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  38.54 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  39.18 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  39.18 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  40.86 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  38.3 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  39.78 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  34.02 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  34 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  31.37 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 309 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 		 299 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  58.14 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  58.14 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0446  DNA binding protein  36.67 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.407825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  34 
 
 		 306 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  31.07 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  52.38 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  52.38 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0496  hypothetical protein  37.88 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0554271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2715  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>