43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8706 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8706    100 
 
 		 456 bp  904    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  86.76 
 
 		 753 bp  400  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    85.78 
 
 		 752 bp  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    85.84 
 
 		 754 bp  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  85.52 
 
 		 753 bp  367  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85 
 
 		 960 bp  341  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  84.7 
 
 		 753 bp  337  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    84.56 
 
 		 753 bp  329  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.46 
 
 		 1041 bp  325  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    83.86 
 
 		 699 bp  309  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  84.01 
 
 		 753 bp  281  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    83.69 
 
 		 753 bp  280  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  82.95 
 
 		 753 bp  274  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  82.65 
 
 		 753 bp  266  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    83.17 
 
 		 972 bp  266  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    82.99 
 
 		 522 bp  250  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    82.28 
 
 		 503 bp  248  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  82.66 
 
 		 753 bp  242  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  83.43 
 
 		 753 bp  242  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83.1 
 
 		 754 bp  234  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    82.22 
 
 		 752 bp  222  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    81.69 
 
 		 450 bp  220  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  80.93 
 
 		 753 bp  204  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  80.75 
 
 		 741 bp  196  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    82.01 
 
 		 716 bp  155  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    79.32 
 
 		 753 bp  151  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    81.11 
 
 		 337 bp  145  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    88.64 
 
 		 189 bp  143  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  82.3 
 
 		 705 bp  131  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  80.14 
 
 		 684 bp  113  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  82.61 
 
 		 753 bp  111  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  82.61 
 
 		 753 bp  111  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    80.7 
 
 		 466 bp  77.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    89.71 
 
 		 104 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    81.29 
 
 		 391 bp  69.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    93.02 
 
 		 243 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    93.02 
 
 		 105 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    92.11 
 
 		 635 bp  52  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    85.96 
 
 		 748 bp  50.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    91.67 
 
 		 201 bp  48.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  91.43 
 
 		 780 bp  46.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.55 
 
 		 1356 bp  46.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  91.43 
 
 		 675 bp  46.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>