36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6829 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6829    100 
 
 		 255 bp  505  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  85.45 
 
 		 906 bp  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  85.45 
 
 		 906 bp  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    85.96 
 
 		 2015 bp  139  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  82.78 
 
 		 906 bp  129  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  82.78 
 
 		 906 bp  129  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7785  integrase catalytic region  87.3 
 
 		 135 bp  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00395813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    83.43 
 
 		 324 bp  121  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    83.51 
 
 		 267 bp  115  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    84.29 
 
 		 802 bp  103  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  81.38 
 
 		 906 bp  95.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3929    81.28 
 
 		 216 bp  93.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  82 
 
 		 735 bp  83.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  81.82 
 
 		 906 bp  77.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  81.82 
 
 		 906 bp  77.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  86.25 
 
 		 900 bp  71.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  86.25 
 
 		 900 bp  71.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8546    85.37 
 
 		 96 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0539  transposase  85 
 
 		 300 bp  63.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0597  integrase, catalytic region  91.3 
 
 		 381 bp  60  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  91.3 
 
 		 840 bp  60  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  91.3 
 
 		 840 bp  60  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  91.3 
 
 		 840 bp  60  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  91.3 
 
 		 840 bp  60  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  91.3 
 
 		 840 bp  60  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  80.62 
 
 		 906 bp  58  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1295    83.53 
 
 		 279 bp  58  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2743    83.15 
 
 		 123 bp  58  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0536    83.75 
 
 		 456 bp  56  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02251  transposase  82 
 
 		 177 bp  56  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  89.36 
 
 		 345 bp  54  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    87.04 
 
 		 943 bp  52  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  83.56 
 
 		 906 bp  50.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1895    91.67 
 
 		 162 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1471  integrase catalytic subunit  96.43 
 
 		 501 bp  48.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.394095  normal  0.129997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1287  hypothetical protein  91.43 
 
 		 189 bp  46.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.868264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>