24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1361 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1361  regulatory protein TetR  100 
 
 		 247 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0882  regulatory protein TetR  87.92 
 
 		 244 aa  377  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4023  putative transcriptional regulator, TetR family  78.44 
 
 		 259 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332964  normal  0.373488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4062  TetR family transcriptional regulator  80.57 
 
 		 257 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3768  TetR family transcriptional regulator  78.73 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4945  TetR family transcriptional regulator  78 
 
 		 283 aa  318  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000126171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1257  regulatory protein TetR  55.76 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0471441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  56.67 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2539  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2266  regulatory protein TetR  41.94 
 
 		 204 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1098  hypothetical protein  38.07 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3282  hypothetical protein  37.75 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0154  hypothetical protein  32.95 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  28.12 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0678  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2820  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1141  hypothetical protein  22.28 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1136  hypothetical protein  23.31 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2449  rpsU-divergently transcribed protein  29.61 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  42  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>