23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0182 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  100 
 
 		 236 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3657  transcription activator effector binding  88.14 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5334  transcription activator effector binding  56.3 
 
 		 255 aa  231  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  56.22 
 
 		 298 aa  225  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  55.76 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  53.91 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  46.63 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  43.83 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  45.27 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  46.31 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  45.64 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  41.53 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  44.97 
 
 		 260 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  44.3 
 
 		 242 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  40.22 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0410  transcription activator effector binding  32.35 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122194  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  24.29 
 
 		 156 aa  48.5  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  27.61 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  26.67 
 
 		 166 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  22.88 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  28.08 
 
 		 274 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  28.7 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.37 
 
 		 158 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>