More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3286 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3286  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3162  GTP cyclohydrolase I  75.36 
 
 		 222 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0558  GTP cyclohydrolase I  70.09 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06235  GTP cyclohydrolase I  69.01 
 
 		 217 aa  308  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000481  GTP cyclohydrolase I type 1  69.01 
 
 		 217 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00675  GTP cyclohydrolase I  67.45 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0383  GTP cyclohydrolase I  70.14 
 
 		 216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0244609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0371  GTP cyclohydrolase I  70.14 
 
 		 216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0372  GTP cyclohydrolase I  70.14 
 
 		 216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0397  GTP cyclohydrolase I  70.14 
 
 		 216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000172091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3834  GTP cyclohydrolase I  71.56 
 
 		 216 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3486  GTP cyclohydrolase I  69.81 
 
 		 214 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0322  GTP cyclohydrolase I  72.51 
 
 		 216 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0458  GTP cyclohydrolase I  69.67 
 
 		 214 aa  300  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0467391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4254  GTP cyclohydrolase I  70 
 
 		 216 aa  298  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4566  GTP cyclohydrolase I  69.67 
 
 		 219 aa  298  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235543 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0321  GTP cyclohydrolase I  71.56 
 
 		 217 aa  298  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3602  GTP cyclohydrolase I  69.19 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3775  GTP cyclohydrolase I  69.19 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.86022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3842  GTP cyclohydrolase I  70.14 
 
 		 219 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0354  GTP cyclohydrolase I  69.19 
 
 		 216 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.689272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1560  GTP cyclohydrolase I  69.95 
 
 		 221 aa  292  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0380  GTP cyclohydrolase I  68.25 
 
 		 219 aa  292  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000683928 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2405  GTP cyclohydrolase I  69.52 
 
 		 222 aa  289  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.626916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2753  GTP cyclohydrolase I  68.84 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02082  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1505  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2542  GTP cyclohydrolase I  67.91 
 
 		 222 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2300  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.014502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2428  GTP cyclohydrolase I  67.91 
 
 		 222 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.821616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2384  GTP cyclohydrolase I  67.91 
 
 		 222 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02041  hypothetical protein  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205869  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1495  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2339  GTP cyclohydrolase I  67.91 
 
 		 222 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2287  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2449  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3287  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0813  GTP cyclohydrolase I  67.44 
 
 		 222 aa  284  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2432  GTP cyclohydrolase I  67.91 
 
 		 222 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2568  GTP cyclohydrolase I  68.08 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2470  GTP cyclohydrolase I  68.08 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3014  GTP cyclohydrolase I  68.08 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1933  GTP cyclohydrolase I  70.09 
 
 		 217 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669415  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0910  GTP cyclohydrolase I  60.48 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1670  GTP cyclohydrolase I  68.08 
 
 		 220 aa  267  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2306  GTP cyclohydrolase I  69.05 
 
 		 222 aa  266  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1941  GTP cyclohydrolase I  69.05 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0853389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0394  GTP cyclohydrolase I  62.74 
 
 		 220 aa  265  5.999999999999999e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.457978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1059  GTP cyclohydrolase  50 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0955  GTP cyclohydrolase  47.37 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1333  GTP cyclohydrolase I  49.76 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0468  GTP cyclohydrolase I  48.31 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00942975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2270  GTP cyclohydrolase I  47.57 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1006  GTP cyclohydrolase I  49.03 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.961128  normal  0.53094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00785  GTP cyclohydrolase I  51.28 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0055  GTP cyclohydrolase I  48.11 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4850  GTP cyclohydrolase  45.03 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  38.86 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  42.46 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  43.09 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  41.11 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  42.31 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  43.41 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  44.07 
 
 		 187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  45.4 
 
 		 198 aa  134  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  37.91 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  41.67 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1278  GTP cyclohydrolase I  41.76 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00712716  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  42.54 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  41.21 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2639  GTP cyclohydrolase I  44.05 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530307  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  41.01 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  37.44 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  41.36 
 
 		 190 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  37.91 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  37.91 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  42.46 
 
 		 194 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  40.48 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  40.98 
 
 		 190 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  38.1 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  41.76 
 
 		 188 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  41.44 
 
 		 187 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  41.94 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  41.94 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  42.01 
 
 		 179 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  41.62 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  41.53 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  40.96 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  37.22 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  40.78 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  40.84 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  41.9 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  36.64 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  37.98 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  38.25 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>