More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1278 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1278  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00712716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  48.09 
 
 		 188 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1275  GTP cyclohydrolase  50 
 
 		 349 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  52.15 
 
 		 207 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 187 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  48.09 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  49.44 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  48.04 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  47.8 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 		 202 aa  181  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  48.63 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  48.63 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  48.63 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  47.59 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  48.63 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  45.36 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  47.85 
 
 		 206 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  46.2 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  47.85 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  48.35 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  47.28 
 
 		 189 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  46.52 
 
 		 195 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  45.41 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  47.54 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  44.86 
 
 		 189 aa  175  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  45.45 
 
 		 194 aa  174  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  44.86 
 
 		 189 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7919  GTP cyclohydrolase I  47.49 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  46.37 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  47.25 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  50.58 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  47.28 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  47.37 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  46.37 
 
 		 213 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  45.11 
 
 		 207 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  46.82 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  45.6 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  44.09 
 
 		 235 aa  171  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  46.99 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  43.32 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 		 198 aa  170  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  48.54 
 
 		 257 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  48.26 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  44.32 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  44.09 
 
 		 247 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  44.32 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0018  GTP cyclohydrolase I  45.21 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00365351  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  48 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  45.11 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  48.55 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  48.54 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  43.55 
 
 		 239 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  43.55 
 
 		 239 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  44.62 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  46.89 
 
 		 218 aa  167  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  43.48 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  44.83 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  47.98 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  43.92 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  42.7 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  43.78 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  44.75 
 
 		 212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  42.78 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  42.16 
 
 		 243 aa  165  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  45.86 
 
 		 190 aa  164  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  45.86 
 
 		 190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  44.63 
 
 		 223 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  44.44 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  45 
 
 		 190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  41.75 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  44.32 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  44.51 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  43.85 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  44.26 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  42.31 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  44.51 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  44.75 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  44.81 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>