More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7919 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7919  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  57.38 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 194 aa  221  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 188 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  52.69 
 
 		 187 aa  218  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 		 185 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 		 189 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 		 188 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  54.95 
 
 		 195 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  56.25 
 
 		 187 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 198 aa  207  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  56.5 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  52.72 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  55.37 
 
 		 188 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 		 202 aa  205  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 		 188 aa  205  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  52.72 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  51.41 
 
 		 192 aa  204  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  58.43 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  56.28 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  56.5 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  54.8 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  57.46 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  55.74 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  59.34 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  55.21 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  52.76 
 
 		 207 aa  197  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  56.04 
 
 		 257 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  51.5 
 
 		 222 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  52.24 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  52.45 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  53.93 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  55.14 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  52.54 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  54.8 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  50.98 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  53.63 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  59.04 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  54.24 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  51.65 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  46.45 
 
 		 189 aa  184  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  45.9 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  46.15 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  45.36 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  46.15 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  48.04 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  46.89 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  48.89 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1278  GTP cyclohydrolase I  47.49 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00712716  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  46.15 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  48.04 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  46.74 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  45.86 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1275  GTP cyclohydrolase  45.86 
 
 		 349 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  46.7 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  48.07 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  44.62 
 
 		 195 aa  171  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  47.49 
 
 		 219 aa  171  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  45.95 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 		 242 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  47.46 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  49.16 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  44.86 
 
 		 247 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  42.86 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  51.12 
 
 		 187 aa  168  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  45.81 
 
 		 241 aa  167  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>