More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3729 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
307 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
307 aa  634    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
307 aa  634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  81.21 
 
 
308 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.93 
 
 
301 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.76 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1646  putative dehydratase  35.43 
 
 
326 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0270  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.43 
 
 
324 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0205  hypothetical protein  34.77 
 
 
325 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190401  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2360  hypothetical protein  26.87 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
373 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.77 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  26.36 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.08 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
335 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  26.71 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.86 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25.98 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0033  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.24 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.14 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  30.43 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.89 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 
342 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
336 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  26.92 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  25.68 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.21 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  24.21 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  27.94 
 
 
336 aa  62.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.21 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.21 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.89 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
324 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 
339 aa  62.4  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  24.21 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 
321 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  25.58 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.9 
 
 
321 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  27.27 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4813  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.44 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
329 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.49 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  28.95 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
336 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
367 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4099  hypothetical protein  25.46 
 
 
334 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.104495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.34 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 
337 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>