228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0493 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0493  putative oxidoreductase  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.304933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0504  putative oxidoreductase  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751997  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0482  putative oxidoreductase  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  80.09 
 
 
298 aa  358  6e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  56.82 
 
 
307 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.64 
 
 
308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  54.22 
 
 
314 aa  236  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.88 
 
 
298 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  52.14 
 
 
314 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  51.53 
 
 
303 aa  228  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.08 
 
 
299 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  57.36 
 
 
300 aa  224  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.12 
 
 
300 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.34 
 
 
305 aa  222  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  50.44 
 
 
302 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  54.3 
 
 
293 aa  221  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.44 
 
 
304 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  49.78 
 
 
314 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.56 
 
 
300 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  57.51 
 
 
288 aa  218  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  53.12 
 
 
303 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.92 
 
 
305 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  56.22 
 
 
292 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  54.15 
 
 
288 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  49.32 
 
 
302 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.72 
 
 
302 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.06 
 
 
294 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  48.47 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  49.77 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  49.12 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  52.06 
 
 
309 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  48.92 
 
 
302 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  50.64 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.49 
 
 
314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.42 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  52.53 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  50 
 
 
294 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  54.08 
 
 
305 aa  212  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  48.25 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  51.13 
 
 
303 aa  211  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  46.93 
 
 
309 aa  211  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  53.66 
 
 
312 aa  211  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  50.23 
 
 
301 aa  210  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.77 
 
 
298 aa  210  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  49.34 
 
 
291 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  48.91 
 
 
316 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  47.83 
 
 
297 aa  208  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  47.39 
 
 
297 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  50.68 
 
 
280 aa  207  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  49.56 
 
 
296 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  47.66 
 
 
295 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  48.4 
 
 
291 aa  204  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.78 
 
 
297 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  47.92 
 
 
324 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  49.56 
 
 
305 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  50.89 
 
 
298 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  48.25 
 
 
301 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.9 
 
 
295 aa  201  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  49.77 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.77 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  49.32 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.79 
 
 
298 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.4 
 
 
328 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  48 
 
 
300 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.79 
 
 
298 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  49.32 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.55 
 
 
319 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  52.04 
 
 
293 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.85 
 
 
296 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2179  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.95 
 
 
291 aa  191  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000102447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  52.06 
 
 
300 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.86 
 
 
322 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7758  ATPase  47.09 
 
 
283 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  47.09 
 
 
328 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  43.84 
 
 
310 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.91 
 
 
291 aa  184  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.67 
 
 
299 aa  184  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  44.44 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3131  ATPase  44.39 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0783  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.56 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.44 
 
 
413 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4082  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.75 
 
 
294 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.418511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  42.79 
 
 
316 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.06 
 
 
295 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  42.37 
 
 
315 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.83 
 
 
307 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  47.44 
 
 
306 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  46.05 
 
 
334 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.31 
 
 
302 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0558  AAA ATPase  39.76 
 
 
333 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.847744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  42.48 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  46.73 
 
 
297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  43.72 
 
 
299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  42.79 
 
 
291 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  45.45 
 
 
294 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  45.41 
 
 
291 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.05 
 
 
306 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.05 
 
 
306 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.39 
 
 
323 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.355314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  41.63 
 
 
326 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>