More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1350 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0603  nucleotide sugar dehydrogenase  92.29 
 
 
441 aa  825    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0685216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1350  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
441 aa  881    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000563405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0495  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.45 
 
 
440 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.156569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0413  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.09 
 
 
440 aa  513  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.394208  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.32 
 
 
906 aa  379  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0697467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.01 
 
 
436 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  39.46 
 
 
435 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 
446 aa  345  7e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  39.24 
 
 
436 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.67 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  40.67 
 
 
440 aa  335  9e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  44.24 
 
 
427 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.48 
 
 
438 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  39.83 
 
 
453 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.49 
 
 
439 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.56 
 
 
450 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.6 
 
 
447 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.72 
 
 
466 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  44.22 
 
 
443 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.88 
 
 
503 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.68 
 
 
451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  38.13 
 
 
450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.87 
 
 
438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
443 aa  325  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  38.51 
 
 
449 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  44.15 
 
 
440 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  37.72 
 
 
466 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.21 
 
 
466 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.21 
 
 
466 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  38.21 
 
 
466 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  37.14 
 
 
437 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  37.14 
 
 
437 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.94 
 
 
467 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  37.97 
 
 
466 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  40.81 
 
 
437 aa  322  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  40.81 
 
 
437 aa  322  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  39.47 
 
 
445 aa  322  8e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  37.94 
 
 
467 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  40.94 
 
 
437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  38.85 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  37.92 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  40 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  37.97 
 
 
482 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  37.06 
 
 
466 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.04 
 
 
457 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
443 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.16 
 
 
447 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.84 
 
 
466 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  38.19 
 
 
464 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.02 
 
 
442 aa  318  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.07 
 
 
442 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.87 
 
 
440 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  38.27 
 
 
470 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.27 
 
 
470 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.27 
 
 
470 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.09 
 
 
446 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.47 
 
 
466 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.83 
 
 
470 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.38 
 
 
448 aa  316  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  38.14 
 
 
440 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.77 
 
 
437 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  42.22 
 
 
435 aa  316  6e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  37.22 
 
 
444 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.06 
 
 
447 aa  315  8e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  38.19 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.16 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.12 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  40.84 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.18 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.72 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  37.83 
 
 
470 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  38.9 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.29 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  38.02 
 
 
454 aa  313  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 
470 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.75 
 
 
452 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.44 
 
 
448 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  39.78 
 
 
440 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  37.44 
 
 
448 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.44 
 
 
448 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  38.89 
 
 
459 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.86 
 
 
442 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0911  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
449 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.27 
 
 
444 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  38.41 
 
 
448 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
466 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.39 
 
 
446 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  40.35 
 
 
439 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.39 
 
 
470 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
445 aa  311  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  37.28 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  38.29 
 
 
454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  37.42 
 
 
445 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.04 
 
 
440 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>