33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0794 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0794  30S ribosomal protein S19e  100 
 
 
141 aa  289  8e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.444721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1156  30S ribosomal protein S19e  100 
 
 
141 aa  289  8e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1519  30S ribosomal protein S19e  97.16 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.903507  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1161  30S ribosomal protein S19e  86.52 
 
 
141 aa  254  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0997  30S ribosomal protein S19e  69.5 
 
 
148 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0118  30S ribosomal protein S19e  58.45 
 
 
149 aa  179  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3015  30S ribosomal protein S19e  56.93 
 
 
140 aa  164  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1973  30S ribosomal protein S19e  49.65 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0535  30S ribosomal protein S19e  53.52 
 
 
148 aa  158  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000147139  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1483  30S ribosomal protein S19e  51.41 
 
 
149 aa  156  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000000838671  hitchhiker  0.000557013 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1887  30S ribosomal protein S19e  52.94 
 
 
199 aa  156  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.3586 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0024  Ribosomal protein S19e  51.06 
 
 
150 aa  153  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0454  30S ribosomal protein S19e  55.88 
 
 
149 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.393602  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1327  Ribosomal protein S19e  49.31 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1572  30S ribosomal protein S19e  52.94 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3485  Ribosomal protein S19e  51.05 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1624  30S ribosomal protein S19e  46.67 
 
 
150 aa  133  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1516  Ribosomal protein S19e  48.95 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.888465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0440  30S ribosomal protein S19e  48.97 
 
 
158 aa  131  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1680  30S ribosomal protein S19e  48.28 
 
 
158 aa  130  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0988  30S ribosomal protein S19e  47.59 
 
 
158 aa  128  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0470  30S ribosomal protein S19e  49.25 
 
 
163 aa  127  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1790  30S ribosomal protein S19e  46.21 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0495408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1981  30S ribosomal protein S19e  47.22 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1926  30S ribosomal protein S19e  43.88 
 
 
151 aa  120  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2312  30S ribosomal protein S19e  42.66 
 
 
151 aa  114  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985969  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1624  30S ribosomal protein S19e  38.62 
 
 
156 aa  104  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000048808  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44019  Ribosomal protein S19, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.52 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.803034 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04060  40S ribosomal protein S19 (S16) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27073]  44.03 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0245853 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1299  Ribosomal protein S19e  40.97 
 
 
153 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51066  predicted protein  39.26 
 
 
152 aa  93.6  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85487  predicted protein  39.13 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0629752  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06100  ribosomal protein S19, putative  37.5 
 
 
161 aa  88.6  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>