33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1682 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0947  L-seryl-tRNA selenium transferase  94.07 
 
 		 354 aa  680    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0999  L-seryl-tRNA selenium transferase  91.24 
 
 		 354 aa  660    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1682  L-seryl-tRNA selenium transferase  100 
 
 		 354 aa  717    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1219  L-seryl-tRNA selenium transferase  69.6 
 
 		 357 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.587199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1169  L-seryl-tRNA selenium transferase  63.69 
 
 		 354 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1320  Selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  25 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603065  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  30.07 
 
 		 398 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  25.18 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  29.41 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  36 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.97 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.97 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  25.98 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  31.96 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  28.85 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  29.27 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  29.03 
 
 		 462 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3738  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  43.04 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241783  normal  0.0172698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  26.03 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  48.15 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11390  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  37.7 
 
 		 508 aa  43.5  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.308467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  36.14 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  30.48 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  30.53 
 
 		 448 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5215  selenocysteine synthase  30.85 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  25.87 
 
 		 470 aa  43.1  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5595  selenocysteine synthase  30.85 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5303  selenocysteine synthase  30.85 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  41.67 
 
 		 484 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25310  seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  36.84 
 
 		 477 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.362155 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  25.95 
 
 		 475 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  46.3 
 
 		 468 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  20.29 
 
 		 368 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>