274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2027 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  100 
 
 
285 aa  593  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  69.35 
 
 
264 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  68.06 
 
 
264 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  70.08 
 
 
283 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  68.97 
 
 
264 aa  394  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  70.88 
 
 
264 aa  394  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  67.82 
 
 
264 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  66.92 
 
 
264 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  67.82 
 
 
264 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  67.43 
 
 
264 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  67.43 
 
 
264 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  68.32 
 
 
264 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  67.68 
 
 
264 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  68.58 
 
 
264 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  66.03 
 
 
264 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  66.67 
 
 
264 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  66.67 
 
 
264 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  67.68 
 
 
264 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  66.41 
 
 
264 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  65.4 
 
 
264 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  66.54 
 
 
264 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  66.67 
 
 
264 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  66.28 
 
 
264 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  66.67 
 
 
264 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  66.41 
 
 
264 aa  377  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  65.52 
 
 
264 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  66.16 
 
 
264 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  66.79 
 
 
264 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  65.65 
 
 
264 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  64.37 
 
 
264 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  63.5 
 
 
277 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  65.65 
 
 
264 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  64.75 
 
 
264 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  67.18 
 
 
264 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  65.13 
 
 
264 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  66.67 
 
 
264 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  67.77 
 
 
276 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  64.75 
 
 
264 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  65.4 
 
 
264 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  65.4 
 
 
264 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  63.98 
 
 
264 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  65.9 
 
 
264 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  66.54 
 
 
264 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  65.13 
 
 
264 aa  376  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  63.97 
 
 
273 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  65.27 
 
 
264 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  65.52 
 
 
264 aa  371  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  65.52 
 
 
264 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  65.9 
 
 
264 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  63.77 
 
 
267 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  61.31 
 
 
277 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  63.98 
 
 
264 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  65.9 
 
 
264 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  64.37 
 
 
264 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  63.84 
 
 
276 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  63.6 
 
 
264 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  63.88 
 
 
264 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  65.13 
 
 
264 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  64.37 
 
 
264 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  62.64 
 
 
267 aa  364  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  59.72 
 
 
283 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  64.15 
 
 
267 aa  362  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  61.3 
 
 
264 aa  362  4e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  61.42 
 
 
269 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  61.09 
 
 
274 aa  362  6e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  63.98 
 
 
267 aa  361  7.0000000000000005e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2432  thymidylate synthase  61.51 
 
 
279 aa  361  7.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  59.49 
 
 
274 aa  361  9e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  60.22 
 
 
277 aa  360  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  63.33 
 
 
273 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  63.22 
 
 
264 aa  359  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  63.77 
 
 
265 aa  358  8e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2032  Thymidylate synthase  63.81 
 
 
271 aa  357  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00060457  hitchhiker  0.0000668058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  62.84 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  61.31 
 
 
277 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  63.02 
 
 
268 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  62.07 
 
 
264 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  62.07 
 
 
280 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  61.98 
 
 
274 aa  353  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  60.92 
 
 
264 aa  353  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  61.62 
 
 
290 aa  353  1e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  62.92 
 
 
272 aa  354  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  62.07 
 
 
264 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  63.64 
 
 
277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  352  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  352  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  352  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  352  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  352  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  60.52 
 
 
271 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  62.07 
 
 
264 aa  350  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  61.69 
 
 
264 aa  350  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  53.18 
 
 
318 aa  350  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  59.77 
 
 
264 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  61.6 
 
 
264 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  61.3 
 
 
264 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  59.77 
 
 
264 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>