24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0566 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0566  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  255  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0197839  hitchhiker  0.00000289186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2995  hypothetical protein  60.68 
 
 
134 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3032  hypothetical protein  58.82 
 
 
121 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.747756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1333  hypothetical protein  55.26 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000163831 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06492  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0843  hypothetical protein  48.31 
 
 
128 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1165  hypothetical protein  39.5 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.273556  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2754  hypothetical protein  39.13 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3139  hypothetical protein  38.26 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3006  hypothetical protein  35.65 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38710  hypothetical protein  33.88 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2917  hypothetical protein  38.26 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3299  hypothetical protein  32.23 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2825  hypothetical protein  36.52 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2177  hypothetical protein  34.78 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669035  normal  0.0733999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2864  hypothetical protein  35.65 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2604  hypothetical protein  32.17 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684626  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4469  hypothetical protein  31.62 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269048  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2273  hypothetical protein  31.58 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3320  protein of unknown function DUF419  27.5 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0206616  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0601  protein of unknown function DUF419  29.17 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1307  protein of unknown function DUF419  29.31 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.233005  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7256  hypothetical protein  27.62 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058114  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0096  protein of unknown function DUF419  28.07 
 
 
114 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.503641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>