52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2416 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 112 aa  229  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  59 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  51.49 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  51.49 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  50 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  45.61 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  46 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  48.48 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  47 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  47 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  46 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  40.21 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  46 
 
 		 101 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  42.42 
 
 		 99 aa  87  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.2 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  43.27 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  40.43 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.33 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.1 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  32.67 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  37.97 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  31 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  36.9 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  36.14 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  30.43 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  34.38 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  33.71 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  33.71 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  33.71 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  41.38 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0278  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.32 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0196  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0152  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.14 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.84 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2232  hypothetical protein  29.58 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.242019  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  26.47 
 
 		 106 aa  40  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>