31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1500 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1500  putative outer-membrane protein  100 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  43.6 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1117  putative outer-membrane protein  38.1 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0367384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  33.59 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  30.24 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  30.92 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  29.96 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  29.87 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  40.4 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1303  hypothetical protein  36.89 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.13528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  25.76 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  26.77 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  26.36 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  26.36 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0509  hypothetical protein  28.51 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.491245  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  32.04 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  31.79 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  28.35 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  29.71 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  32.65 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  31.78 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  34.52 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  28.86 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  30 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  26.19 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  33.02 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  28.57 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  31.43 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  33.02 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  29.69 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000007665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>