More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0968 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0968  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 510 aa  1026    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1373  amino acid permease-associated region  43.03 
 
 		 478 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000761845  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0999  hypothetical protein  41.91 
 
 		 487 aa  356  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1032  hypothetical protein  41.91 
 
 		 487 aa  355  6.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  33.26 
 
 		 473 aa  259  8e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  33.26 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  33.26 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  33.05 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  33.05 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  32.85 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  32.64 
 
 		 473 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  32.64 
 
 		 473 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  36.72 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  33.98 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  33.98 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  32.91 
 
 		 473 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  31.29 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  34.21 
 
 		 468 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  34.2 
 
 		 474 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  33.86 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  32.48 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  32.48 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  32.48 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  32.48 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  32.48 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  32.48 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  32.12 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  32.64 
 
 		 520 aa  239  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  31.26 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  31.26 
 
 		 475 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  30.46 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  31.29 
 
 		 526 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  31.77 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  31.77 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  34.27 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  31.77 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1404  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 		 506 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  31.05 
 
 		 475 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  31.05 
 
 		 475 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  34.27 
 
 		 487 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  33.18 
 
 		 470 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 		 511 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  31.89 
 
 		 473 aa  236  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  31.94 
 
 		 538 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 		 473 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0393  lysine-specific permease  35.65 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.449766  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  31.94 
 
 		 538 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 		 536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  31.12 
 
 		 476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  32.91 
 
 		 526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  32.48 
 
 		 526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  30.07 
 
 		 471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  33.33 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  30.07 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  31.92 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  33.33 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  33.33 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  33.33 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  34.46 
 
 		 488 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  33.33 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  33.33 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  33.33 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  34.72 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  32.74 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  34.72 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  34.72 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  34.72 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  30.07 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  31.6 
 
 		 511 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  34.72 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  32.04 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  32.44 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  32.73 
 
 		 512 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  34.03 
 
 		 489 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 		 469 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  31.98 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  31.98 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  31.2 
 
 		 513 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  32.42 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  32.42 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  32.13 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  31.06 
 
 		 474 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  31.2 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  32.42 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  32.42 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  31.41 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  31.2 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1448  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0115525  hitchhiker  0.00101809 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  32.39 
 
 		 475 aa  228  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  31.41 
 
 		 478 aa  228  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  32.42 
 
 		 488 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>