38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3690 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  82.07 
 
 
318 aa  243  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  56.94 
 
 
798 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  57.86 
 
 
348 aa  174  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  56.43 
 
 
344 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  51.77 
 
 
375 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  52.45 
 
 
345 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  48.28 
 
 
336 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  47.45 
 
 
347 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  43.15 
 
 
314 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  36.11 
 
 
354 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  34.72 
 
 
370 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6674  soluble lytic murein transglycosylase  36.5 
 
 
339 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  28.76 
 
 
325 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  32.45 
 
 
473 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  33.11 
 
 
436 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  42.11 
 
 
360 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  30.82 
 
 
469 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  31.13 
 
 
445 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  38.04 
 
 
490 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  29.52 
 
 
488 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  34.09 
 
 
482 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  30.83 
 
 
476 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  29.17 
 
 
478 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.08 
 
 
427 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  30.71 
 
 
476 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  31.39 
 
 
445 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  33.07 
 
 
438 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  32.31 
 
 
482 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3376  putative lipoprotein  32.93 
 
 
406 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00752899  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  35.65 
 
 
432 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  27.14 
 
 
459 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  30.14 
 
 
445 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  33.06 
 
 
442 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2460  putative lipoprotein  23.88 
 
 
341 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  29.63 
 
 
462 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  35.06 
 
 
421 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  36 
 
 
473 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>